L’estuaire de la Seine est une mosaïque d’habitats essentiels dans les cycles vitaux de nombreuses espèces animales et végétales, parfois rares ou menacées. La présence de contrastes et de gradients (noveau d’eau, salinité, ressource allimentaire) renforce la spécificité de ces milieux estuariens et leur fragilité.

La diversité des milieux estuariens permet l’expression d’une végétation riche et diversifiée : roselière, Schorre, magnocariçaie, mégaphorbiaie, tourbière,…

L’estuaire offre une capacité d’accueil pour de nombreuses espèces animales : mollusques, insectes, crustacés, amphibiens, poissons migrateurs, marins et d’eau douce (+120 espèces) ; oiseaux en migration, nidification, hivernant (~200 espèces régulières) ; mammifères marins ; …