La qualité d’un milieu aquatique est le reflet des pressions passées et actuelles exercées par les activités humaines présentes sur son bassin versant : activités urbaines, industrielles et agricoles. Pour l’estuaire de la Seine, il faut ajouter la remobilisation potentielle de stocks de contaminants présents sur ses abords (couches profondes de certaines vasières, sites et sols pollués,…).

Les sources de pollutions actuelles à l’estuaire de la Seine sont donc multiples et diverses :

• apports du bassin versant amont via la Seine (à Poses) ;
• apports des affluents ou des nappes d’eau souterraines ;
• rejets directs dans l’estuaire via les stations d’épuration urbaines et industrielles ;
• sources diffuses via le ruissellement ou la remise en suspension de sédiments.