Le caractère dynamique des estuaires ne facilite pas leur gestion écologique, surtout lorsque l’on considère leurs usages multiples. Le projet ANPHYECO s’intéresse à La gestion d’un estuaire basée sur une vision à l’échelle globale, avec des objectifs écologiques compréhensibles, acceptables et applicables pour tous les acteurs. ANPHYECO s’est focalisé en priorité sur le diagnostic du fonctionnement écologique de l’estuaire, en étudiant les facteurs limitants pour la production du phytoplancton, du phytobenthos, du zooplancton et du macrozoobenthos ; ces quatre groupes biotiques formant le noyau de la chaîne trophique.

Trois stratégies ont été combinées pour construire et proposer un diagnostic holistique de l’estuaire : 1/une comparaison inter-estuarienne diachronique concernant la physicochimie, 2/une comparaison inter-estuarienne diachronique concernant la morpho-hydrologie, et 3/ une étude comparée du fonctionnement  hydro-sédimentaire de 1960, 1975 et 2010 à partir d’une modélisation 3D qui offre un jeu de données inédit sur l’évolution du fonctionnement physique de l’estuaire.

Les résultats permettent de donner un premier diagnostic qualitatif du système reposant sur de nouvelles connaissances acquises en parallèle et dans la présente étude. Des orientations générales en terme de mesures de gestion sont proposées en conclusion.