Le projet multidisciplinaire FLASH, visait à (i) caractériser la pathogénicité pour l’homme des souches d’E. coli, Enterococcus et Cryptosporidium sp circulant dans les eaux (ii) améliorer les connaissances de la relation entre l’usage vétérinaire et humain en antibiotiques, la dynamique de contamination du milieu en molécules antibiotiques et l’occurrence et le devenir de bactéries antibiorésistantes (iii) identifier l’origine des contaminants microbiens (animal/ humain) (iv) définir les périodes favorables et établir des bilans quantitatifs des apports à l’estuaire en E. coli antibiorésistantes et en antibiotiques, pour différentes conditions hydrologiques et en fonction de la dynamique sédimentaire,(v) déterminer l’exposition de l’homme aux contaminants chimiques et microbiologiques et étudier la représentation qu’ont les acteurs (praticiens hospitaliers et exploitants agricoles) des risques sanitaire et environnemental liés à l’usage des antibiotiques. Le bassin de la Risle a servi de site atelier pour étudier les continuum agricoles et hospitaliers et les usages nautiques. Une étude des pratiques de pêche à pied, exposant les usagers à un risque sanitaire, a été menée sur le littoral proche de l’estuaire.